Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | W3110S.gb | 783,551 | 3 bp→TTG | intergenic (+1/‑35) | nadA → / → pnuC | quinolinate synthase, subunit A/predicted nicotinamide mononucleotide transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | W3110S.gb | 783,551 | 0 | C | T | 100.0% | 1176.2 / NA | 480 | intergenic (+1/‑37) | nadA/pnuC | quinolinate synthase, subunit A/predicted nicotinamide mononucleotide transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (480/0); total (480/0) | |||||||||||
* | W3110S.gb | 783,552 | 0 | G | T | 100.0% | 1179.0 / NA | 480 | intergenic (+2/‑36) | nadA/pnuC | quinolinate synthase, subunit A/predicted nicotinamide mononucleotide transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (480/0); total (480/0) | |||||||||||
* | W3110S.gb | 783,553 | 0 | A | G | 100.0% | 1121.6 / NA | 480 | intergenic (+3/‑35) | nadA/pnuC | quinolinate synthase, subunit A/predicted nicotinamide mononucleotide transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (480/0); total (480/0) |
Only 100 of 480 total aligned reads displayed.
TCGTATGCTGGATTTTGCGGCTACACTACGTGGATAACGAATAATAAGGCGTAACGTTACGCTT > W3110S.gb/783514‑783577 ||| tCGTATGCTGGATTTTGCGGCTACACTACGTGGATAATTGAtaataa > 1:65735/1‑47 (MQ=37) tCGTATGCTGGATTTTGCGGCTACACTACGTGGATAATTGATAATAAGGCGTCACATTACGc > 1:626147/1‑62 (MQ=255) tCGTATGCTGGATTTTGCGGCTACACTACGTGGATAATTGATAATAAGGCGTCACATTACGc > 1:752718/1‑62 (MQ=255) tCGTATGCTGGATTTTGCGGCTACACTACGTGGATAATTGATAATAAGGCGTCACATTACGc > 1:740453/1‑62 (MQ=255) tCGTATGCTGGATTTTGCGGCTACACTACGTGGATAATTGATAATAAGGCGTCACATTACGc > 1:735707/1‑62 (MQ=255) tCGTATGCTGGATTTTGCGGCTACACTACGTGGATAATTGATAATAAGGCGTCACATTACGc > 1:729103/1‑62 (MQ=255) tCGTATGCTGGATTTTGCGGCTACACTACGTGGATAATTGATAATAAGGCGTCACATTACGc > 1:715763/1‑62 (MQ=255) tCGTATGCTGGATTTTGCGGCTACACTACGTGGATAATTGATAATAAGGCGTCACATTACGc > 1:706982/1‑62 (MQ=255) tCGTATGCTGGATTTTGCGGCTACACTACGTGGATAATTGATAATAAGGCGTCACATTACGc > 1:692811/1‑62 (MQ=255) tCGTATGCTGGATTTTGCGGCTACACTACGTGGATAATTGATAATAAGGCGTCACATTACGc > 1:679809/1‑62 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |