Missing coverage evidence...
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CATGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATCAC  >  W3110S.gb/1100506‑1100565                                                            | catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:52951/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:4284/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:44476/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:4614/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:46324/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:46739/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:47428/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:48815/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:4940/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:49456/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:50128/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:50932/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:41611/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:53047/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:53205/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:53897/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:54039/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:54093/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:5688/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:6052/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:6915/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:7324/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:8137/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:27112/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:11347/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:13923/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:16046/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:17180/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:18426/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:22639/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:24132/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:24940/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:25499/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:25663/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:11246/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:27470/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:31977/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:32370/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:34027/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:35400/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:35582/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:35614/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:39843/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:4042/1‑60 (MQ=255) catGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATcac  >  1:4152/1‑60 (MQ=255)                                                            | CATGGCCGCGTTTTCTGCTATCATGCGCGGCATGAACATACTTCTCTCTATTGCAATCAC  >  W3110S.gb/1100506‑1100565

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑