Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2025081	2117274	92194	54 [0]	[0] 13	[fliR]–[wcaM]	[fliR],rcsA,dsrB,yodD,yedP,yedQ,yodC,yedI,yedA,vsr,dcm,yedJ,yedR,yedS,yedS,yedS,yedS,hchA,yedV,yedW,yedX,yedY,yedZ,yodA,yodB,serU,yeeI,asnT,yeeJ,yeeL,yeeL,yeeL,shiA,amn,yeeN,asnW,yeeO,asnU,cbl,nac,asnV,erfK,cobT,cobS,cobU,insH,yoeA,insD,insC,yoeE,yeeP,flu,yeeR,yeeS,yeeT,yeeU,yeeV,yeeW,yoeF,yeeX,yeeA,sbmC,dacD,sbcB,yeeD,yeeE,yeeF,yeeY,yeeZ,yoeB,yefM,hisL,hisG,hisD,hisC,hisB,hisH,hisA,hisF,hisI,cld,ugd,gnd,wbbL,wbbL,insH,wbbL,wbbK,wbbJ,wbbI,wbbH,glf,rfbX,rfbC,rfbA,rfbD,rfbB,galF,[wcaM]

GTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTC  >  W3110S.gb/2025019‑2025080                                                              | gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:48576/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:40552/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:41209/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:41968/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:41993/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:42459/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:43519/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:43934/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:43970/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:44809/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:45716/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:45920/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:46285/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:4664/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:40356/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:48975/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:51422/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:52604/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:52714/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:52749/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:52815/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:52833/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:53191/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:53731/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:777/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:8491/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:915/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:22621/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:11387/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:13468/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:13500/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:13685/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:14041/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:1427/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:1505/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:15122/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:16323/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:1805/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:19097/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:21095/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:21858/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:11386/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:23059/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:25661/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:26137/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:27938/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:2923/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:34617/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:35910/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:37326/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:37961/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:38496/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:40044/1‑62 (MQ=255) gTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTc  >  1:40126/1‑62 (MQ=255)                                                              | GTAGCCGTACTATGTTGCAGGTGACAAGCGAACAATGGCTATCCTGGTTAAACCTGTACTTC  >  W3110S.gb/2025019‑2025080

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑