Missing coverage evidence...
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TCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGCCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGT  >  W3110S.gb/1540434‑1540495 |                                                              tCGACGTTGTTAAACCATGGGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:15056/1‑62 (MQ=25) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTa       >  1:18827/1‑57 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAgg   >  1:29578/1‑61 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:52131/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:39210/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:39782/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:42797/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:44290/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:47349/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:48200/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:48390/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:50329/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:50534/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:51790/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:37558/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:52350/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:53628/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:53877/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:54013/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:7137/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:7461/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:8186/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:9330/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:29357/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:11715/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:12347/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:13505/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:16201/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:17110/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:18085/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:23739/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:27659/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:38266/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:30189/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:31337/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:31515/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:35056/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:35466/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:35784/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:36726/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGt  >  1:11167/1‑62 (MQ=255) tCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGTCCGGTCCAGACGGTTTTACAGGt  >  1:2103/1‑62 (MQ=255) |                                                              TCGACGTTGTTAAACCATGCGTACTCCATGCCTTCGCGCCCGGTCCAGACGTTTTTACAGGT  >  W3110S.gb/1540434‑1540495

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑