Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,749,892 A→G S199S (TCT→TCC tnaA ← tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,749,8920AG100.0% 127.8 / NA 64S199S (TCT→TCCtnaAtryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/64);  total (0/64)

TTCGCGATGCTGTACATCGCTTTTAAGTTTGCCAGTGAAACCGGCTGACCACCTGCAGAGT  >  W3110S.gb/3749836‑3749896
                                                        |    
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         cTGTACATCACTTTTAAGTTTGCCAGTGAAACCGGCTGACCACCTGCGGAGt  <  1:42297/52‑1 (MQ=39)
                       tAAGTTTGCCAGTGAAACCGGCTGACCACCTGCGGAGt  <  1:50577/38‑1 (MQ=255)
                                                        |    
TTCGCGATGCTGTACATCGCTTTTAAGTTTGCCAGTGAAACCGGCTGACCACCTGCAGAGT  >  W3110S.gb/3749836‑3749896

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: