Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,076,148 T→C D771D (GAT→GAC)  glgP → glycogen phosphorylase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,076,1480TC100.0% 508.7 / NA 242D771D (GAT→GAC) glgPglycogen phosphorylase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/242);  total (0/242)

Only 100 of 242 total aligned reads displayed.

AGGTACTGGCGGATTATCGCAGCTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGATGAACTCTACGA  >  W3110S.gb/4076099‑4076159
                                                 |           
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aGGTACTGGCGGATTATCGCAGTTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGACGAACTCTACGa  <  1:11241/61‑1 (MQ=255)
aGGTACTGGCGGATTATCGCAGTTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGACGAACTCTACGa  <  1:11183/61‑1 (MQ=255)
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 ggTACTGGCGGATTATCGCAGTTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGACGAACTCTACGa  <  1:14913/60‑1 (MQ=255)
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     cTGGCGGATTATCGCAGTTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGACGAACTCTACGa  <  1:1474/56‑1 (MQ=255)
     cTGGCGGATTATCGCAGTTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGACGAACTCTACGa  <  1:10369/56‑1 (MQ=255)
            aTTATCGCAGTTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGACGAACTCTACGa  <  1:2498/49‑1 (MQ=38)
              tATCGCAGTTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGACGAACTCTACGa  <  1:43948/47‑1 (MQ=38)
                 cGCAGTTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGACGAACTCTACGa  <  1:48992/44‑1 (MQ=38)
                      ttATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGACGAACTCTACGa  <  1:34406/38‑1 (MQ=38)
                                                 |           
AGGTACTGGCGGATTATCGCAGCTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGATGAACTCTACGA  >  W3110S.gb/4076099‑4076159

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑