| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 713380 = | 32 (0.830) | 40 (1.130) | 26/92 | NT | 60.0% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | W3110S.gb | = 4125340 | 24 (0.680) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
GTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATAT > W3110S.gb/713312‑713449 | gTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTAtt < 1:1261308/71‑1 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCa < 1:1813856‑M1/5‑1 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAg > 1:2489752‑M1/66‑71 (MQ=255) ttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGc > 1:593256/1‑71 (MQ=255) aaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataat < 1:2849828‑M1/2‑1 (MQ=255) tGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCt > 1:3011180/1‑69 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGc < 1:2281154‑M1/7‑1 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt < 1:3037211‑M1/8‑1 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt < 1:3046233‑M1/8‑1 (MQ=255) aaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAg > 1:1141640‑M1/61‑71 (MQ=255) aggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa > 1:3139661‑M1/59‑59 (MQ=255) aggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa > 1:2371470‑M1/59‑59 (MQ=255) gtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa > 1:3085201‑M1/57‑57 (MQ=255) gtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGacac > 1:1019713‑M1/57‑71 (MQ=255) ggCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgca > 1:3374021/1‑71 (MQ=255) acgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgca < 1:2490674‑M1/19‑1 (MQ=255) gCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgca > 1:1256397/1‑70 (MQ=255) cgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTa < 1:752775‑M1/9‑1 (MQ=255) ttGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:2759634/1‑71 (MQ=255) actgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGacac < 1:484932‑M1/15‑1 (MQ=255) gctttgaacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt < 1:472799‑M1/26‑1 (MQ=255) tttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt < 1:2591607‑M1/26‑1 (MQ=255) ttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa > 1:2075198‑M1/39‑50 (MQ=255) ttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa > 1:3202031‑M1/39‑50 (MQ=255) cTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaa < 1:333895/71‑1 (MQ=255) tGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaa < 1:488899/70‑1 (MQ=255) ccGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc < 1:864606/70‑1 (MQ=255) aaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:1805977‑M1/33‑42 (MQ=255) gATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg < 1:3558540/51‑1 (MQ=255) ccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:2035186‑M1/30‑71 (MQ=255) caggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa > 1:560305‑M1/29‑56 (MQ=255) aTTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:3295370/1‑40 (MQ=255) aTTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:2605324/1‑40 (MQ=255) aTTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:2154014/1‑70 (MQ=255) aggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGa > 1:1387941‑M1/28‑60 (MQ=255) ttATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTaa < 1:2166774/36‑1 (MQ=255) ttATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaaa > 1:724511/1‑62 (MQ=255) ggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAg < 1:1452717‑M1/45‑1 (MQ=255) ggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAg > 1:3301320‑M1/27‑71 (MQ=255) gagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa > 1:379996‑M1/26‑37 (MQ=255) gagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa > 1:2013107‑M1/26‑37 (MQ=255) gagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt < 1:3295107‑M1/46‑1 (MQ=255) agtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt > 1:3394972‑M1/25‑71 (MQ=255) aTTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:1996653/1‑36 (MQ=255) gtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGa > 1:491930‑M1/24‑66 (MQ=255) gtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGa > 1:496182‑M1/24‑66 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:2975897‑M1/23‑44 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc > 1:698619‑M1/23‑59 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:2374341‑M1/23‑64 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGa > 1:2303788‑M1/23‑65 (MQ=255) tcgtttcacacgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGa > 1:2395312‑M1/23‑65 (MQ=255) cATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGaca > 1:1188053/1‑35 (MQ=255) cATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGaca > 1:784785/1‑35 (MQ=255) cATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcac > 1:2791559/1‑41 (MQ=255) cATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:139713/1‑71 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:3442916‑M1/21‑70 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:2913554‑M1/21‑70 (MQ=255) atatACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:3027729/70‑1 (MQ=255) tataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt < 1:656422/66‑1 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:1335406‑M1/53‑1 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:391958‑M1/53‑1 (MQ=255) ataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgca > 1:3108931/1‑37 (MQ=255) ataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgca > 1:811159/1‑37 (MQ=255) ataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgca > 1:2784568/1‑37 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:740118‑M1/53‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:2800807‑M1/53‑1 (MQ=255) cacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:2627470‑M1/17‑70 (MQ=255) cTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:1605127/1‑71 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAGACGATTGAAGTTGATGATGAActc > 1:2875454‑M1/13‑71 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt > 1:2473891‑M1/13‑59 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt > 1:1851381‑M1/13‑59 (MQ=255) cTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt < 1:695249/59‑1 (MQ=255) ggCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGa > 1:3135483/1‑49 (MQ=255) ggCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAt > 1:3202505/1‑50 (MQ=255) ggCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:1126457/1‑66 (MQ=255) cgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:1040444‑M1/11‑71 (MQ=255) cgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:1161901‑M1/11‑71 (MQ=255) gCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa < 1:2980267/70‑1 (MQ=255) gCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa < 1:2984372/70‑1 (MQ=255) gCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTAGATGATGAACTCTAc < 1:751181/71‑1 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa > 1:2310762‑M1/8‑41 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtga < 1:3535744‑M1/49‑1 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa < 1:3086267‑M1/56‑1 (MQ=255) ttGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAg > 1:519668/1‑68 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaaa < 1:2178211‑M1/36‑1 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:2297077‑M1/5‑71 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:3052338‑M1/5‑71 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:127326/69‑1 (MQ=255) tATTCAGCTAAGACACTTCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTatat < 1:1243669/71‑1 (MQ=255) | GTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATAT > W3110S.gb/713312‑713449 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |