| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 315707 | NA (NA) | 67 (1.240) | 40/100 | NT | 100% | coding (654/687 nt) | ykgA | predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | W3110S.gb | 576911 = | 0 (0.000) | coding (76/498 nt) | ybcS | predicted lysozyme | |||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
CCATCATTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA > W3110S.gb/576842‑576979 | ctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaa > 1:3274071‑M2/70‑70 (MQ=255)ctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaAc < 1:1274691‑M2/2‑1 (MQ=255)ctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaAc < 1:444517‑M2/2‑1 (MQ=255) catcatTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCAc < 1:4184496/70‑1 (MQ=255) catcatTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCAc < 1:504737/70‑1 (MQ=255) catcatTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACt < 1:2392620/71‑1 (MQ=255) tcatTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtg > 1:4199518‑M2/1‑69 (MQ=255) agtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaa > 1:2016946‑M2/67‑67 (MQ=255) agtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTgg > 1:2806855‑M2/67‑71 (MQ=255) agtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTgg > 1:1938664‑M2/67‑71 (MQ=255) atTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgat > 1:2672139‑M2/1‑67 (MQ=255) atTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtga < 1:4359122‑M2/70‑4 (MQ=255) ccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGcc > 1:1519348‑M2/64‑70 (MQ=255) cggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGccc < 1:3320370‑M2/8‑1 (MQ=255) ttgaaAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatctt > 1:2948079‑M2/3‑64 (MQ=255) ttgaaAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatctt > 1:11751‑M2/3‑64 (MQ=255) aCGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatct > 1:3104838‑M2/1‑64 (MQ=255) aCGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatct < 1:3992102‑M2/70‑7 (MQ=255) gAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttac < 1:3083515‑M2/71‑10 (MQ=255) atttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaa < 1:5138449‑M2/1‑1 (MQ=255) atttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGt > 1:1810595‑M2/56‑70 (MQ=255) tttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTaa > 1:3525111‑M2/55‑71 (MQ=255) gCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagc > 1:2388820‑M2/1‑57 (MQ=255) ttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaa > 1:4143860‑M2/54‑54 (MQ=255) ttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAAc > 1:3304055‑M2/54‑71 (MQ=255) ttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAAc > 1:273517‑M2/54‑71 (MQ=255) tgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAAc < 1:732180‑M2/18‑1 (MQ=255) tgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAAc < 1:3686789‑M2/18‑1 (MQ=255) cGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTt < 1:402001‑M2/56‑2 (MQ=255) gaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACg < 1:1300200‑M2/19‑1 (MQ=255) ttGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaata > 1:2278829‑M2/1‑53 (MQ=255) ttGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaat > 1:2574843‑M2/1‑53 (MQ=255) gctgctgctATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgat < 1:2218163‑M2/55‑5 (MQ=255) aacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaa < 1:3017078‑M2/1‑1 (MQ=255) ctgctgctATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagt > 1:2048259‑M2/1‑50 (MQ=255) ctATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacg > 1:823469‑M2/1‑44 (MQ=255) acctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGaa < 1:1855718‑M2/30‑1 (MQ=255) ctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGt < 1:3828315‑M2/15‑1 (MQ=255) ctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGt < 1:2550453‑M2/15‑1 (MQ=255) aTTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACt > 1:1657593/1‑42 (MQ=255) aTTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcg < 1:2272503‑M2/71‑30 (MQ=255) cgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAAAGATGGTCTGGAAGgtg > 1:4015450‑M2/38‑71 (MQ=255) ggtggCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgat < 1:866845‑M2/43‑5 (MQ=255) gcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGgtgt < 1:2364597‑M2/35‑1 (MQ=255) gtggCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggcta > 1:386419‑M2/1‑38 (MQ=255) gCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagt > 1:806745‑M2/1‑35 (MQ=255) ggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGt < 1:3616850‑M2/15‑1 (MQ=255) ggAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagaggacacgcggctaagt < 1:2625625‑M2/69‑37 (MQ=255) ggAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagc > 1:5144712‑M2/1‑33 (MQ=255) ctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAca > 1:2568730‑M2/29‑71 (MQ=255) ctgtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAc > 1:735301‑M2/29‑70 (MQ=255) gtgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTgg < 1:4257042‑M2/28‑1 (MQ=255) tgtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGt < 1:2846066‑M2/12‑1 (MQ=255) aaTTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagt < 1:4679242‑M2/48‑21 (MQ=255) aaTTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatag < 1:5194655‑M2/47‑20 (MQ=255) gtccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCt > 1:2512438‑M2/25‑50 (MQ=255) ttGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaa > 1:22959‑M2/1‑26 (MQ=255) ttGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaa > 1:1425899‑M2/1‑26 (MQ=255) ttGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagaaatagtggacacgcggctaagtgagtaaact < 1:4443136‑M2/71‑46 (MQ=255) tccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCt < 1:1597096‑M2/40‑1 (MQ=255) tccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAG‑GGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCt < 1:4990731‑M2/39‑1 (MQ=255) ccatattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAcatacca > 1:328455‑M2/23‑70 (MQ=255) gCTATAGCATCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaata < 1:3346496‑M2/42‑19 (MQ=255) catattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGaa > 1:3895682‑M2/22‑51 (MQ=255) catattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAcataccat < 1:3036038‑M2/49‑1 (MQ=255) atattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAcataccata > 1:328961‑M2/21‑70 (MQ=255) tattacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAcataccata > 1:2409775‑M2/20‑69 (MQ=255) attacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCt > 1:1518849‑M2/19‑58 (MQ=255) attacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCt > 1:2402277‑M2/19‑58 (MQ=255) attacgtgggtaggatcaACTGGCACAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACa > 1:982355‑M2/19‑70 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGa > 1:888406‑M2/18‑37 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGa > 1:1104314‑M2/18‑37 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGa > 1:457642‑M2/18‑37 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGgt > 1:1556270‑M2/18‑50 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACa > 1:1028884‑M2/18‑69 (MQ=255) ttacgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACa > 1:4912137‑M2/18‑69 (MQ=255) acgtgggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACa > 1:4059212‑M2/16‑67 (MQ=255) tCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcag > 1:847674‑M2/1‑15 (MQ=255) tCAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcag > 1:662721‑M2/1‑15 (MQ=255) gggtaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGatat < 1:2985135‑M2/59‑1 (MQ=255) cAGTGTTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagag < 1:3418355‑M2/70‑57 (MQ=255) gtgtTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggct > 1:1364182‑M2/1‑12 (MQ=255) ggaggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTa < 1:5038873‑M2/41‑1 (MQ=255) tgtTAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaa < 1:3589319‑M2/54‑44 (MQ=255) ttAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagt > 1:4758529‑M2/1‑9 (MQ=255) ttAATCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagt > 1:1750668‑M2/1‑9 (MQ=255) ggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTgg > 1:844937‑M2/7‑71 (MQ=255) ggatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATAAAAAGATATTGTTgg > 1:1052708‑M2/7‑71 (MQ=255) gatcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGaa < 1:2518571‑M2/30‑1 (MQ=255) atcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAca < 1:2709034‑M2/43‑1 (MQ=255) atcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGgtg < 1:4866204‑M2/67‑1 (MQ=255) atcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGgtg < 1:2839502‑M2/67‑1 (MQ=255) tcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAcatacca > 1:2695282‑M2/4‑51 (MQ=255) tcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGgtg > 1:3015257‑M2/4‑70 (MQ=255) tcaACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGgtg > 1:4775210‑M2/4‑70 (MQ=255) tCACTtgatcttacccagcaatagtggacacgcggctaagtgagtaaactctcagtcagaggtgactcaca > 1:57337‑M2/1‑5 (MQ=255) caACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTa > 1:2101690‑M2/3‑71 (MQ=255) caACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTa > 1:3478196‑M2/3‑71 (MQ=255) caACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTa > 1:2760171‑M2/3‑71 (MQ=255) aCTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAca > 1:417622/1‑43 (MQ=255) | CCATCATTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA > W3110S.gb/576842‑576979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |