| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 713380 = | 32 (0.550) | 48 (0.890) | 19/92 | NT | 59.9% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | W3110S.gb | = 4125340 | 35 (0.650) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATA > W3110S.gb/713313‑713448 | cacgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc > 1:697304‑M1/68‑71 (MQ=255)cacgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc > 1:435157‑M1/68‑71 (MQ=255) taaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa > 1:1909041‑M1/64‑64 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:1131838‑M1/62‑71 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:5132933‑M1/62‑71 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:4656002‑M1/62‑71 (MQ=255) aaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:273232‑M1/61‑70 (MQ=255) cAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:1920173/1‑71 (MQ=255) cAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:1649794/1‑71 (MQ=255) cAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:4702075/1‑71 (MQ=255) cAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:682711/1‑71 (MQ=255) ggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc > 1:5567821‑M1/55‑58 (MQ=255) gacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgc > 1:4273023‑M1/54‑71 (MQ=255) gacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactg > 1:4971476‑M1/54‑70 (MQ=255) gaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa > 1:1186705‑M1/51‑51 (MQ=255) tGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:4915888/1‑70 (MQ=255) tGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:4547230/1‑70 (MQ=255) tGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:3745061/1‑70 (MQ=255) tGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:1854628/1‑70 (MQ=255) ctgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGa < 1:2834986‑M1/24‑1 (MQ=255) ctgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGa < 1:238992‑M1/24‑1 (MQ=255) aCGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAt > 1:3208459/1‑71 (MQ=255) aCGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAt > 1:4666969/1‑71 (MQ=255) cTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATAGTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa < 1:5124717/71‑1 (MQ=255) cTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa < 1:4079893/71‑1 (MQ=255) cTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa < 1:3496948/71‑1 (MQ=255) tCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTTGCGACTTGTATTCAGCt < 1:951633/48‑1 (MQ=255) tCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCt < 1:2382725/48‑1 (MQ=255) ctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcagtgca < 1:3881160‑M1/19‑1 (MQ=255) ccGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCt < 1:3512352/47‑1 (MQ=255) gCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa < 1:2100608/71‑1 (MQ=255) cTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa < 1:1658630/37‑1 (MQ=255) cTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa < 1:2529038/37‑1 (MQ=255) cTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa < 1:3404885/37‑1 (MQ=255) cTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa < 1:2202222/37‑1 (MQ=255) cTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa < 1:154857/37‑1 (MQ=255) cTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa < 1:1488499/37‑1 (MQ=255) tacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaaa < 1:2437787‑M1/36‑1 (MQ=255) tacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaaa < 1:322024‑M1/36‑1 (MQ=255) tacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaaa < 1:5344030‑M1/36‑1 (MQ=255) gCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc > 1:1821505/1‑71 (MQ=255) ccGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc > 1:2106425/1‑70 (MQ=255) ccGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc > 1:1610817/1‑70 (MQ=255) gATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg < 1:3029759/71‑1 (MQ=255) ggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAg < 1:4950138‑M1/45‑1 (MQ=255) gagtcgtttcccccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt < 1:4093743‑M1/46‑1 (MQ=255) gagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt > 1:2811889‑M1/26‑71 (MQ=255) gagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt < 1:4674228‑M1/46‑1 (MQ=255) gagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt < 1:2451630‑M1/46‑1 (MQ=255) gagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt > 1:2056658‑M1/26‑71 (MQ=255) agtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt > 1:5078431‑M1/25‑70 (MQ=255) ttCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt < 1:1125229/70‑1 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtga < 1:3475536‑M1/49‑1 (MQ=255) cgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtga > 1:1453003‑M1/22‑70 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatg > 1:792177‑M1/21‑71 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatg > 1:4338994‑M1/21‑71 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatg > 1:857622‑M1/21‑71 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATGGAAGTtga > 1:2511083‑M1/21‑69 (MQ=255) tttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatg > 1:2085380‑M1/20‑70 (MQ=255) tataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:5172522/69‑1 (MQ=255) tataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:4274652/69‑1 (MQ=255) tataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:3935039/69‑1 (MQ=255) tataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:1813619/69‑1 (MQ=255) tataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:1244782/69‑1 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg < 1:3521280‑M1/42‑1 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:4092879‑M1/53‑1 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:4978295‑M1/53‑1 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:3579724‑M1/53‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcac < 1:4397317‑M1/20‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcac < 1:1158689‑M1/20‑1 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGa > 1:1614460/1‑41 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGa > 1:2700617/1‑41 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGa > 1:4649092/1‑41 (MQ=255) cacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:3887222‑M1/17‑70 (MQ=255) cacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:4577271‑M1/17‑70 (MQ=255) cacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:4569418‑M1/17‑70 (MQ=255) cacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:5264778‑M1/17‑70 (MQ=255) cacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:3412656‑M1/17‑70 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt > 1:939244‑M1/13‑58 (MQ=255) cTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActc > 1:4724856/1‑71 (MQ=255) gcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAtt < 1:5353585‑M1/41‑1 (MQ=255) gcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAtt < 1:1529460‑M1/41‑1 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtg > 1:4004953‑M1/7‑54 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc > 1:4077587‑M1/7‑71 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc > 1:2469347‑M1/7‑71 (MQ=255) aCTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:5242263/56‑1 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc > 1:3503943‑M1/5‑69 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:4330459‑M1/5‑71 (MQ=255) ataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtat > 1:286941‑M1/4‑71 (MQ=255) ataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtat > 1:3451261‑M1/4‑71 (MQ=255) ataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtat > 1:648240‑M1/4‑71 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtata > 1:4902050/1‑71 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtata > 1:4742113/1‑71 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtata > 1:2315232/1‑71 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtata > 1:2179232/1‑71 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtat < 1:2769370/70‑1 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:3826100/69‑1 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:3906129/69‑1 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:746605/69‑1 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:4407048/69‑1 (MQ=255) | TTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATA > W3110S.gb/713313‑713448 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |