| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 436259 = | 48 (0.700) | 38 (0.600) | 21/96 | NT | 49.0% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | minE | = 2706018 | 35 (0.550) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATAT > minE/436189‑436328 | gAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa > 1:1677874/1‑71 (MQ=255)gAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa > 1:1428555/1‑71 (MQ=255) tttttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTAtt > 1:1159927/1‑70 (MQ=255) tttttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTAtt > 1:829227/1‑70 (MQ=255) acgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataAtt < 1:1559192‑M1/3‑1 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAg > 1:909792‑M1/66‑71 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAg > 1:1114773‑M1/66‑71 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAg < 1:2398173‑M1/6‑1 (MQ=255) ttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGc > 1:3044839/1‑71 (MQ=255) ttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGc > 1:2396669/1‑71 (MQ=255) gtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGc < 1:121671‑M1/7‑1 (MQ=255) cTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCt < 1:456367/70‑1 (MQ=255) tGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCt > 1:499723/1‑69 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt < 1:3395930‑M1/8‑1 (MQ=255) cAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTaa < 1:428289/69‑1 (MQ=255) cAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:305125/1‑71 (MQ=255) gCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTaa < 1:624669/66‑1 (MQ=255) cAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactg < 1:2265724/71‑1 (MQ=255) cAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactg < 1:3976621/71‑1 (MQ=255) cAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactg < 1:4104440/71‑1 (MQ=255) gCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcac > 1:3935684/1‑71 (MQ=255) cgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgca < 1:2308901‑M1/19‑1 (MQ=255) tGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTaa < 1:2637919/58‑1 (MQ=255) tGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTaa < 1:2670086/58‑1 (MQ=255) actgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcactg < 1:2081790‑M1/22‑1 (MQ=255) gACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg < 1:3036879/69‑1 (MQ=255) gACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGa > 1:1416325/1‑71 (MQ=255) cTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa < 1:2461409/55‑1 (MQ=255) tATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAt > 1:2319590/1‑67 (MQ=255) ggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgca < 1:3359313‑M1/19‑1 (MQ=255) ggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgca < 1:3343440‑M1/19‑1 (MQ=255) gctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa > 1:1985380‑M1/42‑69 (MQ=255) gctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa > 1:2455820‑M1/42‑69 (MQ=255) gctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa > 1:2122017‑M1/42‑69 (MQ=255) gctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGa > 1:1500057‑M1/42‑71 (MQ=255) gctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGa > 1:3614042‑M1/42‑71 (MQ=255) tCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAg < 1:1528974/69‑1 (MQ=255) gCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc > 1:1857508/1‑71 (MQ=255) ccGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTAt < 1:2512644/35‑1 (MQ=255) ccGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc < 1:2833742/70‑1 (MQ=255) ccGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc > 1:2070641/1‑70 (MQ=255) ggATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGaca > 1:1958298/1‑44 (MQ=255) accaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACg < 1:3147881‑M1/38‑1 (MQ=255) accaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGATAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAtt < 1:2876262‑M1/41‑1 (MQ=255) gATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGc > 1:3737040/1‑36 (MQ=255) gATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAtt > 1:1721512/1‑70 (MQ=255) aTTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGa < 1:2745700/71‑1 (MQ=255) tATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAg > 1:2362003/1‑70 (MQ=255) tATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt > 1:1906152/1‑71 (MQ=255) tATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt > 1:2406683/1‑71 (MQ=255) agtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt > 1:1220756‑M1/25‑71 (MQ=255) aTTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt < 1:1157210/70‑1 (MQ=255) ttCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTCAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt < 1:603893/70‑1 (MQ=255) gtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt < 1:677761‑M1/47‑1 (MQ=255) tCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaaa > 1:1480531/1‑58 (MQ=255) cgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAt > 1:1362140‑M1/22‑61 (MQ=255) cgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAt > 1:3212634‑M1/22‑61 (MQ=255) atatACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:449729/70‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc < 1:3584982‑M1/37‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt < 1:2786084‑M1/47‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:1914416‑M1/53‑1 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg < 1:3232139/71‑1 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg < 1:922558/71‑1 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtga < 1:1377464/66‑1 (MQ=255) cacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:1066170‑M1/17‑70 (MQ=255) cacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:2221971‑M1/17‑70 (MQ=255) aCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGa > 1:1914047/1‑49 (MQ=255) tCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAtt > 1:222142/1‑55 (MQ=255) ccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAAct < 1:2235892‑M1/58‑1 (MQ=255) ccTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAAct > 1:3797094/1‑71 (MQ=255) cTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActc < 1:3181756/71‑1 (MQ=255) tGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg < 1:1173068/65‑1 (MQ=255) gcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActc < 1:375991‑M1/59‑1 (MQ=255) ggCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGa > 1:3952357/1‑49 (MQ=255) gaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAg > 1:2137292‑M1/10‑54 (MQ=255) gaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatga < 1:3333617‑M1/52‑1 (MQ=255) gCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGGAGt > 1:3736815/1‑55 (MQ=255) gACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAg > 1:1361404/1‑71 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaaa < 1:783100‑M1/36‑1 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaaa < 1:1383607‑M1/36‑1 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaaa < 1:3387265‑M1/36‑1 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaaa < 1:2366356‑M1/36‑1 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATTATGaa > 1:3574765‑M1/8‑63 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:2476949‑M1/8‑63 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:1189468‑M1/8‑63 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:1194329‑M1/8‑63 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:2648507‑M1/8‑63 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActct > 1:3414889‑M1/8‑67 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGa > 1:2117706‑M1/7‑45 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAAc < 1:4088551‑M1/57‑1 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc > 1:2052464‑M1/7‑71 (MQ=255) aCTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc > 1:3725209/1‑71 (MQ=255) aCTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc > 1:3639484/1‑71 (MQ=255) ataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtg > 1:1057059‑M1/4‑51 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtata > 1:1387104‑M1/3‑71 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtata > 1:3681719‑M1/3‑71 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtata < 1:3075299‑M1/69‑1 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:4057852/69‑1 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:2373334/69‑1 (MQ=255) ATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTatat > 1:475128‑M1/1‑70 (MQ=255) | GAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATAT > minE/436189‑436328 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |