Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA minE 277,510 Δ1 bp coding (1601/1992 nt) cyoB ← cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE277,5070C.100.0% 879.4 / NA 244coding (1604/1992 nt)cyoBcytochrome o ubiquinol oxidase subunit I
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base . (244/0);  total (244/0)

Only 100 of 244 total aligned reads displayed.

AAGAGGTTGCCCACTCCAGCGTACGGCCACCCCACGGGTCGCCAGTCAGGTCACGGTTCTGGT  >  minE/277478‑277540
                             |                                 
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aaGAGGTTGCCCACTCCAGCGTACGGCCA‑CCCACGGGTCGCCAGTCAGGTCACGGTTCTggt  >  1:658654/1‑62 (MQ=255)
aaGAGGTTGCCCACTCCAGCGTACGGCCA‑CCCACGGGTCGCCAGTCAGGTCACGGTTCTggt  >  1:650973/1‑62 (MQ=255)
aaGAGGTTGCCCACTCCAGCGTACGGCCA‑CCCACGGGTCGCCAGTCAGGTCACGGTTCTggt  >  1:632866/1‑62 (MQ=255)
aaGAGGTTGCCCACTCCAGCGTACGGCCA‑CCCACGGGTCGCCAGTCAGGTCACGGTTCTggt  >  1:617136/1‑62 (MQ=255)
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aaGAGGTTGCCCACTCCAGCGTACGGCCA‑CCCACGGGTCGCCAGTCAGGTCACGGTTCTggt  >  1:565586/1‑62 (MQ=255)
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aaGAGGTTGCCCACTCCAGCGTACGGCCA‑CCCACGGGTCGCCAGTCAGGTCACGGTTCTggt  >  1:533415/1‑62 (MQ=255)
aaGAGGTTGCCCACTCCAGCGTACGGCCA‑CCCACGGGTCGCCAGTCAGGTCACGGTTCTggt  >  1:515484/1‑62 (MQ=255)
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                             |                                 
AAGAGGTTGCCCACTCCAGCGTACGGCCACCCCACGGGTCGCCAGTCAGGTCACGGTTCTGGT  >  minE/277478‑277540

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑