Missing coverage evidence...
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GGGAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCC  >  minE/372659‑372720                                                              | gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:516198/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:998974/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:944980/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:877736/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:854908/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:852956/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:850680/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:748322/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:706289/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:677244/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:521052/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:1072352/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:49738/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:387418/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:385745/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:375643/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:366313/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:352976/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:320107/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:123945/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:1078926/62‑1 (MQ=255) gggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:1075666/62‑1 (MQ=255)  ggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:599967/61‑1 (MQ=255)  ggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:704070/61‑1 (MQ=255)  ggAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:158955/61‑1 (MQ=255)  ggAAGTACTTCAACAGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:766525/61‑1 (MQ=255)  ggAAGGACTTCAACGGAGGTGTTTACCACCATTGACGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGcc  <  1:152334/61‑1 (MQ=255)                                                              | GGGAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCC  >  minE/372659‑372720

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑