Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | minE | 692208 | 694741 | 2534 | 343 [0] | [0] 2 | [hyaC]–[appC] | [hyaC],hyaD,hyaE,hyaF,[appC] |
Only 100 of 343 total aligned reads displayed.
ATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTT > minE/692146‑692207 | aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCTCTGGttt < 1:270419/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:57489/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:694853/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:679013/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:674428/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:657957/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:651825/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:632587/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:624235/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:612417/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:596955/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:587746/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:577891/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:699210/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:551403/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:546254/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:537175/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:526582/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:518945/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:512881/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:509817/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:499192/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:497097/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:487761/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:1000976/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:845042/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:992779/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:981248/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:956080/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:953562/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:94423/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:921125/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:909929/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:901283/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:890796/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:876246/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:870967/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:474214/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:835261/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:826789/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:819250/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:812546/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:788985/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:782758/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:777227/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:773258/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:762425/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:751908/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:73835/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:1133723/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:193101/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:463733/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:177963/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:170084/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:166306/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:148283/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:145479/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:136377/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:127615/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:11597/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:18213/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:1131821/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:1121051/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:111192/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:1107596/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:110054/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:1069335/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:1056216/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:1014511/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:1009680/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:1002980/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:379281/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:443542/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:436788/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:424806/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:413429/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:40371/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:391196/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:386008/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:198229/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:372215/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:348233/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:32337/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:314881/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:310337/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:293324/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:334523/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:256862/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:236946/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:199749/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:212946/62‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:220925/62‑1 (MQ=255) tCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:68755/61‑1 (MQ=255) tCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:950306/61‑1 (MQ=255) tCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:1052002/61‑1 (MQ=255) cacccAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:1077789/58‑1 (MQ=255) cGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCTTCACTGGttt < 1:1091981/60‑1 (MQ=255) aGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:1025302/55‑1 (MQ=255) gATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:408970/48‑1 (MQ=255) gCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGttt < 1:867412/40‑1 (MQ=255) | ATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTT > minE/692146‑692207 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |