Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2109636 2112489 2854 167 [0] [0] 348 [agaB]–agaI [agaB],agaC,agaD,agaI

Only 100 of 167 total aligned reads displayed.

CGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATG  >  minE/2109594‑2109635
                                         |
cGGAAGGGTAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:241608/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:558297/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:665564/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:664671/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:662430/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:654493/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:645539/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:633922/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:625676/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:622897/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:614987/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:604566/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:581793/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:694922/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:538440/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:537806/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:528999/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:520288/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:51657/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:509429/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:494855/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:48401/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:469601/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:467561/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:462082/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:832848/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:990047/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:98147/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:92256/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:920468/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:910055/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:899988/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:895890/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:88396/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:875690/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:86858/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:862161/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:851796/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:458313/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:825733/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:798033/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:788579/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:754533/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:747905/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:731670/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:728021/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:726847/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:707977/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:705165/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:700437/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:120559/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1000163/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:184505/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:174769/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:169139/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:161645/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:156739/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:148243/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:137153/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:133858/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:133140/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:127901/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:121881/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:202216/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1126541/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1102119/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1090331/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1069842/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1065089/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1059104/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1044450/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1037568/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1035503/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1023375/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1005381/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:329296/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:449934/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:446818/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:422407/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:419515/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:412730/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:398748/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:395087/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:393544/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:388032/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:373281/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:360318/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:341771/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:223615/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:329095/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:328128/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:323612/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:321383/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:309157/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:285205/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:273077/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:253389/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:250982/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:230467/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTATATGTCGATg  >  1:776759/1‑42 (MQ=255)
                                         |
CGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATG  >  minE/2109594‑2109635

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: