Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2129583 2133848 4266 420 [0] [0] 21 mtr–[nlpI] mtr,deaD,[nlpI]

Only 100 of 420 total aligned reads displayed.

TAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGC  >  minE/2129521‑2129582
                                                             |
 aaGGAAGAGTTGTTGGGTTAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:605323/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGTCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:401447/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:742937/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:751864/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:739889/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:736399/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:731611/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:723512/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:712441/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:702449/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:690095/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:688059/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:671262/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:660974/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:652368/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:644068/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:630368/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:625528/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:600576/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:587630/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:569981/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:559739/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:546337/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:528121/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:517444/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:506859/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:867067/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:982562/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:97748/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:969544/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:960011/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:939342/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:928392/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:923159/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:917084/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:906199/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:89481/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:881723/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:877397/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:499999/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:855365/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:848544/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:838460/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:834877/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:829396/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:810086/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:801110/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:795897/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:788085/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:772562/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:759894/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:136608/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:245995/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:241065/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:221720/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:207220/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:201073/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:192131/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:181488/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:174462/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:161573/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:15323/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:143313/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:258678/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:115999/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:1134650/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:1109436/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:110260/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:1093442/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:1084713/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:1068803/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:1056697/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:1039821/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:1023589/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:1013991/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:389942/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:494659/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:490579/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:487069/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:475272/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:467325/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:453146/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:443272/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:436420/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:427849/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:42134/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:411887/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:100438/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:374320/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:367156/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:35019/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:325033/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:310298/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:304823/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:294748/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:285538/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:280170/61‑1 (MQ=255)
 aaGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:26790/61‑1 (MQ=255)
               gggATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:12846/47‑1 (MQ=255)
                      tgtgtCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGc  <  1:341689/40‑1 (MQ=255)
                                                             |
TAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGC  >  minE/2129521‑2129582

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑