Missing coverage evidence...
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CCCGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTGG  >  minE/2386190‑2386251                                                              | cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:834164/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:507419/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:51770/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:603701/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:663271/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:668776/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:738731/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:759651/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:807619/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:439255/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:840336/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:893779/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:923844/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:942434/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:947356/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:968153/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:969771/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:969772/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:245965/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:1020961/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:1032230/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:1086969/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:1109292/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:1123689/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:1140658/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:146948/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:216400/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:1007540/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:262460/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:291393/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:306003/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:372395/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:384596/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:408309/62‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:409577/62‑1 (MQ=255) cccGCCGTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:800238/62‑1 (MQ=255)  ccGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTgg  <  1:11522/61‑1 (MQ=255)                                                              | CCCGCCTTGCAACAGGGAGAGCTGGATCTGGTAATGACGTCCGATATTCTGCCGCGCAGTGG  >  minE/2386190‑2386251

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑