Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2543842 2544984 1143 222 [0] [1] 2 [rfaL]–[rfaC] [rfaL],[rfaC]

Only 100 of 222 total aligned reads displayed.

CAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTATT  >  minE/2543795‑2543841
                                              |
cAATAGCGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:371859/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:585755/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:702736/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:693546/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:687348/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:684769/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:649448/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:648800/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:64248/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:633323/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:626074/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:617951/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:615344/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:600073/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:714393/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:568579/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:553292/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:549802/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:548776/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:547388/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:539546/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:533824/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:523891/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:513976/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:503057/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:478438/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:843371/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:969446/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:956768/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:954466/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:942067/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:93505/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:933279/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:923332/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:908317/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:890600/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:875003/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:873259/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:860863/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:452335/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:82954/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:822119/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:811786/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:797567/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:780572/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:762818/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:752981/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:751486/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:745394/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:732625/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:714935/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1106320/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:190058/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:185383/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:166696/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:157211/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:154398/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:140442/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:115722/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:11415/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1137095/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:113288/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1129010/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1115051/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:197669/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1100478/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1092215/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1076051/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1075866/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1063125/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:106061/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1046478/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1035257/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1028682/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:102643/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1020850/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:362802/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:447126/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:438836/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:424553/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:422723/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:413693/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:409398/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:406331/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:386744/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:380633/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:368484/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:364694/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1001668/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:355124/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:35055/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:348094/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:324011/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:318920/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:299205/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:281660/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:272736/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:260790/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:230693/1‑47 (MQ=255)
cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:213594/1‑47 (MQ=255)
                                              |
CAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTATT  >  minE/2543795‑2543841

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑