Missing coverage evidence...
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GGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGC  >  minE/85999‑86060                                                              | ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:6647/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:1004497/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:423848/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:460994/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:539855/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:563520/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:585411/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:616244/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:617255/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:649612/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:659412/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:6614/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:381302/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:669822/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:682435/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:736917/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:760857/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:801221/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:809208/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:836918/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:872197/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:965335/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:99299/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:115243/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:1032278/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:1037692/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:1049585/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:1060255/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:1068060/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:1089874/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:1107910/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:1121070/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:1129698/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:1131669/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:368510/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:124966/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:152147/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:196585/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:217568/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:234345/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:265739/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:324188/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:326526/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:328249/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:339140/1‑62 (MQ=255) ggggCATGGTAGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGc  >  1:924511/1‑62 (MQ=255)                                                              | GGGGCATGGTCGGTACCTGATTGCCGAAGCAGATGAGAGTGATGCATCGTTCCTGCATCTGC  >  minE/85999‑86060

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑