Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2814623 2826801 12179 130 [0] [1] 325 [yjcC]–[cutA] [yjcC],soxS,soxR,nrfA,nrfB,nrfC,nrfD,nrfE,nrfF,nrfG,pheU,yjdC,dipZ,[cutA]

Only 100 of 130 total aligned reads displayed.

AAGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTATAT  >  minE/2814585‑2814622
                                     |
aaGCGAATGTTTAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:392798/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:619326/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:711495/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:707824/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:698693/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:683448/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:679457/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:672146/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:667257/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:648241/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:644710/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:629573/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:623770/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:621197/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:734459/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:613927/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:58620/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:581757/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:579854/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:572854/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:554464/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:545577/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:540541/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:52441/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:489513/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:872783/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:988187/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:9823/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:95860/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:945185/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:934940/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:922831/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:918075/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:911524/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:906620/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:902790/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:897318/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:892641/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:100666/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:868449/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:865610/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:850977/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:821501/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:816904/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:805274/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:802837/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:794975/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:779099/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:751522/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:740998/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:1137185/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:252567/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:486788/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:226093/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:225914/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:1017474/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:195298/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:182491/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:181862/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:180900/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:123754/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:118533/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:272014/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:1110210/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:1109538/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:1107447/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:1093753/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:1078875/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:1071257/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:1065904/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:1047850/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:1039091/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:1036357/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:1025502/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:354641/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:477104/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:47290/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:465455/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:442400/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:440594/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:421864/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:38781/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:380162/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:3770/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:364386/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:356210/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:345927/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:345625/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:33858/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:331069/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:32843/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:309847/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:304208/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:295249/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:292312/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:287684/38‑1 (MQ=255)
aaGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTAACTTTatat  <  1:991159/38‑1 (MQ=255)
 aGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:1004349/37‑1 (MQ=255)
 aGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:244418/37‑1 (MQ=255)
  gCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTatat  <  1:202566/36‑1 (MQ=255)
                                     |
AAGCGAATGTTGAATATTATTCGTGGCTATCTTTATAT  >  minE/2814585‑2814622

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: