Missing coverage evidence...
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GGGTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTC  >  minE/2976568‑2976629                                                              | gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCTGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:1106530/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:337968/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:968122/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:923690/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:918919/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:875099/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:869562/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:867840/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:734576/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:722547/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:689692/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:59653/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:54719/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:451949/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:433696/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:403838/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:1070640/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:334174/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:290305/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:262158/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:243216/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:241563/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:198281/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:18355/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:183421/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:128512/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:1140015/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:1107137/1‑62 (MQ=255) gggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:1096974/1‑62 (MQ=255) gggTTAAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:142888/1‑62 (MQ=255) aggTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTc  >  1:360938/2‑62 (MQ=255)                                                              | GGGTTCAGCTGCGGTTCCTGCGGCAGATAACCAATCTTGATGTCTGGCTGCGGACGCGCTTC  >  minE/2976568‑2976629

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑