Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 245901 247269 1369 246 [0] [0] 236 [phoB]–[phoR] [phoB],[phoR]

Only 100 of 236 total aligned reads displayed.

ATAGATAACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCT  >  minE/247270‑247331
|                                                             
atagttaACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:348270/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGGTCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:729597/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:759101/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:76883/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:747940/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:731704/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:719252/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:710372/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:702357/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:673613/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:651770/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:642729/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:619616/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:600547/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:593868/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:57682/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:573760/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:56825/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:566182/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:561759/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:538639/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:52457/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:522032/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:503614/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:494920/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:878212/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:981814/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:967286/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:937290/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:935948/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:925795/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:913216/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:906192/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:901451/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:89824/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:891781/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:888961/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:880389/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:48802/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:867575/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:857733/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:84524/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:840914/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:833924/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:798212/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:795590/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:795340/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:788101/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:779750/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:778071/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:148902/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:1001722/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:227937/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:212340/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:208771/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:200768/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:195514/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:193952/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:187896/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:176080/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:173476/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:162401/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:2428/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:147563/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:12329/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:1141695/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:1126425/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:1100264/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:1090054/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:1072793/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:1061194/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:1052304/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:1032670/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:1023433/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:342170/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:48374/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:466768/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:443577/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:424943/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:419828/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:411783/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:407780/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:396985/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:384158/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:376049/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:362244/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:249215/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:331761/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:329615/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:329313/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:32186/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:314486/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:306937/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:298351/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:292855/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:278136/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:266528/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCt  <  1:25224/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGAATTCGAACCt  <  1:821656/62‑1 (MQ=255)
atagataACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGAGATTTCGAACCt  <  1:122448/62‑1 (MQ=255)
|                                                             
ATAGATAACGGCCTCAAGGTGTCTGGCAACGAAGATCAGCTACGCAGTGCGATTTCGAACCT  >  minE/247270‑247331

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: