Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1227141 1227251 111 176 [0] [0] 106 pphA/yebY serine/threonine‑specific protein phosphatase 1/hypothetical protein

Only 100 of 106 total aligned reads displayed.

ATTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACG  >  minE/1227252‑1227312
|                                                            
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAAct  <  1:1115561/61‑2 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:691300/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:789779/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:78698/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:778063/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:771259/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:766764/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:748708/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:744314/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:727096/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:718550/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:713401/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:705160/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:795750/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:678474/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:675217/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:667765/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:650033/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:625453/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:624021/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:623150/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:591619/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:585423/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:572988/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:57061/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:559487/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:895588/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:985467/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:973640/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:972925/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:971896/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:963297/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:945984/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:942679/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:9421/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:936757/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:903054/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:896275/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1015683/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:893318/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:886368/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:874887/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:868719/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:8588/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:853895/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:848033/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:840252/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:818955/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:811055/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:797244/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1082404/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:205760/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:197959/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:181186/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:155701/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:148287/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:118224/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:11570/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1133313/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1132698/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1105794/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1092320/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1088598/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:212852/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1081203/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1080474/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:107659/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1070933/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1064937/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:106162/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1036273/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1032832/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1027898/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1020535/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:1001358/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:385869/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:521096/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:498839/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:49869/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:492429/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:492162/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:47480/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:46518/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:453858/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:430185/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:429526/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:406870/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:385484/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:345748/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:344471/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:332383/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:320149/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:297319/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:287210/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:279833/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:268142/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:264061/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:214537/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGATCGTTCTATAAACg  <  1:579328/61‑1 (MQ=255)
aTTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGCTAATTAACAGAGTTTATCAGCTCGTTCTATAAACg  <  1:543457/61‑1 (MQ=255)
|                                                            
ATTGGAAATCAAAAGGCTATTTTAGGTAATTAACAGAGTTTTTCAGCTCGTTCTATAAACG  >  minE/1227252‑1227312

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑