Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1441409 1441526 118 353 [0] [0] 154 rcsD phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

Only 100 of 154 total aligned reads displayed.

TTAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGT  >  minE/1441527‑1441588
|                                                             
ttAAAGTTCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:1012489/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCTCCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:755905/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCCCCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:260336/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAACGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:353392/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:665195/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:817660/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:811315/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:806137/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:790335/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:778428/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:752432/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:722034/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:690365/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:686387/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:843530/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:661890/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:661515/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:656046/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:64976/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:637891/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:62798/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:61219/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:60370/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:579167/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:573500/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:567092/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:916029/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:992795/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:979772/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:973383/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:972364/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:968987/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:965096/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:964589/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:961049/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:959413/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:943043/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:938829/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:932485/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:818860/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:914768/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:90970/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:898341/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:896107/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:88643/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:879243/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:870843/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:86643/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:849186/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:848604/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:56013/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:117641/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:217566/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:217500/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:192839/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:191177/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:187066/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:179585/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:170855/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:169453/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:150545/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:144899/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:121707/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:233963/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:115294/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:1121438/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:1095921/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:108636/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:1084638/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:1078635/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:1077529/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:1042251/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:102792/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:1023483/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:1009716/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:405622/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:543623/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:529736/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:527892/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:51169/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:49570/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:476070/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:469000/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:448087/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:447103/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:433485/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:428076/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:415596/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:1001473/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:379983/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:360088/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:329078/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:325939/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:318240/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:306915/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:260876/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:256538/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:247384/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGATCCCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:90716/62‑1 (MQ=255)
ttAAAGAGCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCAcgtcgt  <  1:71493/62‑1 (MQ=255)
|                                                             
TTAAAGATCTCACCTCCGGATTTAAAGAATCGACCGTCAGCGACATTGTTGATTCACGTCGT  >  minE/1441527‑1441588

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑