Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1809709 1821634 11926 234 [0] [1] 206 [yqaA]–[norV] [yqaA],yqaB,argQ,argZ,argY,argV,serV,csrA,alaS,recX,recA,ygaD,mltB,gutQ,norR,[norV]

Only 100 of 206 total aligned reads displayed.

CGACGATGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCTGG  >  minE/1821631‑1821672
    |                                     
cgacgaTTAATAACGTTATGATGCCTAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:407827/42‑1 (MQ=255)
    gaTTAATAACGTTATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:404677/38‑1 (MQ=38)
    gaTGAATAACGTTATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:687488/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCctggctgg  <  1:563561/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:612056/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:764231/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:757113/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:751974/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:73723/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:705484/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:697204/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:670479/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:665547/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:664552/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:649380/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:62807/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:770562/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:580889/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:575968/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:57005/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:553524/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:53638/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:528239/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:516278/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:500819/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:884453/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:996932/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:991017/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:988746/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:984289/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:961601/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:956082/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:932447/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:93052/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:919466/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:900746/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:890372/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:886426/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:487617/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:875277/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:869680/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:86109/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:851447/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:829947/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:825061/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:817651/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:803671/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:798256/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:786602/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:77258/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:124075/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:101179/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:24761/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:233274/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:224737/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:207342/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:188001/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:183647/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:17607/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:168695/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:139985/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:128821/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:126927/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:249260/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:1137049/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:1124648/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:1110637/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:1104744/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:1100394/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:1063105/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:1051654/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:104115/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:1036201/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:1022620/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:1022136/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:274215/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:468252/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:451769/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:449041/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:440235/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:433461/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:426459/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:423483/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:419816/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:394755/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:39273/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:374627/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:370450/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:365037/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:356594/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:342656/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:332912/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:326755/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:308426/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:297641/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:282076/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:254629/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCCGGCtgg  <  1:639392/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATAACGTGATGACGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:1074213/38‑1 (MQ=255)
    gaTGAATACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCtgg  <  1:731502/37‑1 (MQ=38)
    |                                     
CGACGATGAATAACGTGATGATGCCGAAAATCGCCGGGCTGG  >  minE/1821631‑1821672

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: