Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2109530 2109593 64 29 [0] [0] 187 agaB N‑acetylgalactosamine‑specific enzyme IIB component of PTS

Only 100 of 187 total aligned reads displayed.

CGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATG  >  minE/2109594‑2109635
|                                         
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCCGTAAAGTTTATGTCGa    >  1:1022035/1‑40 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTAt         >  1:158077/1‑35 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCg     >  1:30554/1‑39 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGa    >  1:631376/1‑40 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGAt   >  1:100124/1‑41 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGAt   >  1:514817/1‑41 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGAt   >  1:589728/1‑41 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGAt   >  1:32994/1‑41 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGAt   >  1:625814/1‑41 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGAt   >  1:209605/1‑41 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGAt   >  1:920411/1‑41 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGAt   >  1:961733/1‑41 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:569245/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:645539/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:633922/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:92256/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:622897/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:98147/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:614987/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:60982/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1000163/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:655853/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:558297/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:548694/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:537806/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:528999/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:520288/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:990047/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:509429/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:494855/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:470843/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:469601/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:743830/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:88396/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:875690/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:862368/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:854305/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:832848/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:825733/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:798033/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:788579/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:754533/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:899988/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:895890/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:730624/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:726847/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:707977/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:705165/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:910055/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:700437/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:694922/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:665564/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:663705/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:120559/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:467561/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:19963/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:184505/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:169139/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:161645/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:148243/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1417/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:135204/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:133140/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:130281/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:126361/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:22861/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1126541/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1102119/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1081275/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1068329/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1059104/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1057935/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1044450/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1037568/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:102475/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:1005381/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:349390/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:458464/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:452700/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:446818/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:43173/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:421464/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:419515/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:408796/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:397446/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:393544/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:388032/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:373281/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:234950/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:337782/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:329095/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:328128/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:323612/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:315375/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:285205/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:261858/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:253389/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:250982/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTATATGTCGATg  >  1:776759/1‑42 (MQ=255)
cGGAAGAGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATg  >  1:180498/1‑42 (MQ=255)
|                                         
CGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATG  >  minE/2109594‑2109635

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑