Missing coverage evidence...
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CGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGGA  >  minE/2383713‑2383774 |                                                              cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCTCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:127929/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:79871/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:617400/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:627778/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:647430/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:662465/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:667388/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:696409/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:71410/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:734295/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:734798/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:736107/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:761246/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:604204/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:808324/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:828789/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:847212/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:861065/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:870114/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:874241/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:8854/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:926008/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:97219/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:989962/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:311708/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:1007069/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:1009174/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:1040703/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:1058635/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:1119844/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:12796/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:148/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:243772/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:295117/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:297418/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:1000082/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:328989/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:364402/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:468868/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:51100/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:515802/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:529848/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:539689/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:583617/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:60003/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGGTCGTCAATCTGga  <  1:685235/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCACGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:1011764/62‑1 (MQ=255) cGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGAAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGga  <  1:473769/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGCATCCCAGTCGCTACGACGCAGCGGTAAACCTTCGCGCAGCGCCGGTTCGTCAATCTGGA  >  minE/2383713‑2383774

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑