Missing coverage evidence...
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CGCGCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGC  >  minE/2494384‑2494445 |                                                              cgcgcgGTATCTAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:666755/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCTAAATCAACTAATTCCCTACGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:452423/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCTAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:195623/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCTAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:274627/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCTAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:264391/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCTAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:211082/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCTAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:841627/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCTAAATCAAATAATTCCCTACGGCCGCGTGGCGGGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:779245/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:79202/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:489680/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:885319/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:944092/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:950772/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:972521/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:771113/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:769231/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:996460/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:619046/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:586509/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:55854/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:1000255/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:392374/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:179877/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:176954/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:1126023/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:1093875/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:1092151/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:1083048/62‑1 (MQ=255) cgcgCCGTATCGAAATCAACTAATTCCATAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGc  <  1:1126942/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGCGCCGTATCGAAATCAACTAATTCCCTAAGGCCGCCTGGCGCGGCCTGACATCTCCATGC  >  minE/2494384‑2494445

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑