Missing coverage evidence...
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TATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGA  >  minE/81141‑81202 |                                                              tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGTGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:475022/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:577349/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:995677/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:969341/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:934335/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:932255/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:927488/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:872463/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:85027/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:791402/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:784843/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:635529/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:627638/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:1000758/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:472321/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:373527/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:223205/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:1142232/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:1131401/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:1077943/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:1063641/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:1029/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:1008658/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGGGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:63755/62‑1 (MQ=255) tATTTCTGGATGGCGGTCATTGCGCTGGGTGGCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGa  <  1:1123528/62‑1 (MQ=255) |                                                              TATTTCTGGATGTCGGTCATTGCGCTGGGTGTCGCCTTCGCCCTGTACCTTGCCGGCAAAGA  >  minE/81141‑81202

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑