Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1440313 1447026 6714 595 [0] [2] 241 rcsD–[rcsC] rcsD,rcsB,[rcsC]

Only 100 of 595 total aligned reads displayed.

CCTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCC  >  minE/1440252‑1440312
                                                            |
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:634574/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:719348/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:711624/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:704802/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:700146/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:695096/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:683460/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:677013/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:668784/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:66273/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:651906/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:647459/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:639520/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:722719/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:630641/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:62189/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:605810/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:598746/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:583125/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:566791/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:558444/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:54841/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:541083/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:100840/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:525533/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:836735/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:938032/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:933495/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:926866/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:915689/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:904853/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:895947/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:882384/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:875224/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:867800/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:850413/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:84439/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:533917/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:834196/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:82465/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:814261/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:792768/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:789486/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:777670/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:769916/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:758118/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:753272/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:74616/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:734825/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:196269/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:318182/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:311813/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:522394/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:299710/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:281985/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:277488/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:26677/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:245384/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:235456/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:217709/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:204193/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:305405/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:178582/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:172129/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:161359/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:150469/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:141608/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:138473/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:127701/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:118272/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:111448/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:106279/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:425524/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:518660/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:503611/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:488470/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:480577/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:459276/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:449405/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:445319/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:429409/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:323688/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:416465/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:339333/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:354354/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:398654/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:359503/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:388776/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:368073/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:373696/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:40732/61‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTAC‑TTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:252213/60‑1 (MQ=255)
ccTGCTACCAGCAGAGCCGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:857173/61‑1 (MQ=255)
 cTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:211020/60‑1 (MQ=255)
     tACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:347949/56‑1 (MQ=255)
         agcagAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:43479/52‑1 (MQ=255)
               gCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:188852/46‑1 (MQ=255)
                   ggACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:888798/42‑1 (MQ=255)
                    gACCAGGTGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:471181/41‑1 (MQ=255)
                       cAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAAccc  <  1:802057/38‑1 (MQ=255)
                                                            |
CCTGCTACCAGCAGAGCTGGGACCAGGAGGGACAGTACTTTAACTTTCATGTTATTAACCC  >  minE/1440252‑1440312

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑