Missing coverage evidence...
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ATCGCCGCCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCA  >  minE/1539555‑1539618                                                                | aTCGCCGCCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGAT‑‑TTGGTCTGCCAGTCa  <  1:759210/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:209730/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:892787/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:852229/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:769365/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:736442/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:73424/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:713063/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:699266/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:686824/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:641992/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:537488/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:521178/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:477184/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:474215/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:421208/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:410795/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:299578/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:15852/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGGCTGCCAGTCa  <  1:72674/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGGCTGCCAGGCa  <  1:372476/62‑1 (MQ=255)   cgccgcCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGAGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:571175/62‑1 (MQ=255)    gccgccAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:532705/61‑1 (MQ=255)    gccgccAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:73706/61‑1 (MQ=255)       gccAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCa  <  1:28127/58‑1 (MQ=255)                                                                | ATCGCCGCCAAATTCATCGTCATCATCATTACTGCGCGTATGTTGATAGTTGGTCTGCCAGTCA  >  minE/1539555‑1539618

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑