Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2531973 2543774 11802 119 [0] [0] 215 [kdtA]–[rfaL] [kdtA],rfaQ,rfaG,rfaP,rfaS,rfaB,rfaI,rfaJ,rfaY,rfaZ,rfaK,[rfaL]

Only 100 of 119 total aligned reads displayed.

TGTGCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGC  >  minE/2531911‑2531972
                                                             |
tgtgCTGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:129359/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGTCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:334567/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:653397/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:663143/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:650953/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:638222/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:618547/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:58731/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:548962/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:547067/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:533401/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:517497/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:50271/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:498350/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:492642/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:484205/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:102137/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:476612/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:47653/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:462852/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:456237/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:410318/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:788017/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:928711/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:906269/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:887978/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:832182/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:827383/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:801140/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:799474/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:79617/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:793279/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:482151/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:774053/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:771361/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:763051/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:756983/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:756245/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:741607/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:691029/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:683119/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:668994/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:242746/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:314276/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:310437/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:304667/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:140288/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:252825/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:2506/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:247380/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:146797/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:398771/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:202310/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:202086/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:197579/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:187174/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:186746/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:162205/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:170302/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:169269/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:324675/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:373387/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:371664/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:356004/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:349457/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:339838/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:129785/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:33214/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:318230/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:393162/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:398677/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:317875/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:317797/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:133183/62‑1 (MQ=255)
tgtgCGCCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:452277/62‑1 (MQ=255)
tgtgAGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:759006/62‑1 (MQ=255)
ggtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:752004/61‑1 (MQ=255)
cgtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:30725/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCTACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:540073/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:439275/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:92239/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:81392/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:848031/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:857536/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:865137/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:881978/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:79767/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:169414/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:792288/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:237115/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:692465/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:267990/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:648419/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:642663/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:308369/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:58601/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:578917/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:338423/61‑1 (MQ=255)
 gtgCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:463740/61‑1 (MQ=255)
                     ttATGCCCACCACTATCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGc  <  1:111566/41‑1 (MQ=38)
                                                             |
TGTGCGGCAGCTTCCAGCGGATTATGCCCACCACGTTCAACCAGTGAACCGCCAACAAAGGC  >  minE/2531911‑2531972

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: