Missing coverage evidence...
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TTGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCAA  >  minE/1072821‑1072882 |                                                              ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:627161/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:919603/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:910641/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:898488/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:825950/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:768073/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:70185/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:655588/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:650539/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:648823/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:10068/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:602226/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:575801/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:560247/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:527364/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:28983/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:260843/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:23509/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:190640/62‑1 (MQ=255) ttGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCaa  <  1:167826/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTGATGTTACCAACAATGAAAGTGACACTGTCACCTTTTACCGTACTGCCGTCTAGAATCAA  >  minE/1072821‑1072882

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑