Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | minE | 1151126 | 1155505 | 4380 | 522 [0] | [0] 445 | ydjQ–[astB] | ydjQ,ydjR,spy,astE,[astB] |
Only 100 of 445 total aligned reads displayed.
ACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACG > minE/1155506‑1155567 | aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGGGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:577374/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACgg > 1:289665/1‑35 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAAc > 1:125905/1‑61 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:633710/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:719202/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:706477/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:704083/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:700917/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:691012/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:683570/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:676517/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:672848/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:654419/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:649015/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:6431/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:638122/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:737031/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:624481/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:615135/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:610154/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:604602/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:592149/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:586598/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:583870/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:565917/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:5571/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:545916/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:825728/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:92633/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:914702/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:903255/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:892197/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:886763/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:877998/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:864726/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:854163/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:842068/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:836878/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:830997/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:725416/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:806896/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:794613/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:78169/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:776525/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:764389/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:759176/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:757591/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:75140/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:747909/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:742379/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:536865/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:214866/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:103025/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:317662/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:311156/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:304837/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:278955/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:268684/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:253382/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:247769/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:237841/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:232264/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:224682/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:321813/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:205464/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:199578/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:193438/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:188518/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:185183/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:16345/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:155020/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:144728/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:141045/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:1152/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:339102/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:527973/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:518180/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:509152/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:489587/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:481259/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:473411/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:469561/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:463594/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:458331/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:446580/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:43117/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:422140/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:411532/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:404701/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:394068/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:389622/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:381359/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:375930/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:358861/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:354087/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:344949/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:327733/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTAAGGTTGGCAACg > 1:816855/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTACAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:1738/1‑62 (MQ=255) aCAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTACAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACg > 1:135072/1‑62 (MQ=255) | ACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACG > minE/1155506‑1155567 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |