Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1155568 1156660 1093 427 [0] [0] 225 [astB]–[astD] [astB],[astD]

Only 100 of 225 total aligned reads displayed.

CACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCT  >  minE/1156661‑1156722
|                                                             
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCa                        >  1:260286/1‑40 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGaa              >  1:636718/1‑50 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGaa              >  1:182370/1‑50 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTcc      >  1:333578/1‑58 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGc   >  1:720658/1‑61 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGc   >  1:169096/1‑61 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:662326/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:735823/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:730578/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:727472/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:716830/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:713287/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:710766/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:698346/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:691610/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:669389/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:665346/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:751990/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:658116/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:65512/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:652197/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:651135/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:639589/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:63547/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:633501/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:630278/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:618140/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:610793/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:843994/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:936079/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:932646/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:922055/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:920988/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:906270/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:898456/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:885353/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:884433/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:87945/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:857660/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:853503/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:744737/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:833477/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:829894/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:822434/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:812254/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:800714/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:789638/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:784770/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:774715/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:766307/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:755847/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:106221/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:215648/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:320363/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:316884/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:314826/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:296037/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:28905/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:277795/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:270459/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:264039/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:25360/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:235550/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:223075/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:325042/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:209569/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:207305/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:191685/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:188834/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:164973/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:152572/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:149192/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:139718/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:124738/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:115114/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:100330/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:494542/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:588474/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:565277/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:563474/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:557270/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:55145/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:541200/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:535189/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:522360/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:512706/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:500047/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:594750/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:472023/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:471343/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:450782/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:435021/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:431301/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:41946/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:408319/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:391613/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:3663/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:337560/1‑62 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACAGCCCATCTCAAGGGCgag                >  1:574718/1‑48 (MQ=255)
cACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACAGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCt  >  1:356820/1‑62 (MQ=255)
|                                                             
CACCTCATCGATAATTAGCGGATTATTACCGCCCATCTCAAGGGCGAGAATTTTCTCCGGCT  >  minE/1156661‑1156722

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑