Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1338130 1338546 417 327 [0] [0] 314 [wcaE]–[wcaD] [wcaE],[wcaD]

Only 100 of 314 total aligned reads displayed.

CCGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAC  >  minE/1338547‑1338587
|                                        
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTTAGCCAAATCTGAc  >  1:613139/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCTAAATCTGAc  >  1:256010/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCaaa        >  1:209072/1‑35 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGa   >  1:417180/1‑40 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGa   >  1:487593/1‑40 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGa   >  1:292849/1‑40 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGa   >  1:420932/1‑40 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:663171/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:63319/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:637242/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:653651/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:605074/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:675886/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:684242/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:690794/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:705854/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:71694/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:620702/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:74262/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:598065/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:59390/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:588339/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:578747/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:574642/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:567576/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:562595/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:55688/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:546282/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:818482/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:928938/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:92410/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:915130/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:912670/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:90794/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:89195/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:882987/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:861001/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:84281/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:838104/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:832811/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:829455/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:723249/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:810355/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:804696/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:79724/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:785193/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:771030/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:763221/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:75976/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:753283/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:748347/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:518401/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:73616/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:21679/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:322417/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:303685/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:299199/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:289052/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:263999/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:260845/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:248318/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:24334/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:231083/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:22605/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:220360/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:32657/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:20020/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:190828/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:184854/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:177007/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:160252/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:156967/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:147969/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:144668/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:142475/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:127151/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:111162/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:402916/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:537925/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:531321/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:103881/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:504666/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:485575/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:477094/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:461606/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:454399/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:441486/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:412369/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:409947/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:543050/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:389201/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:379855/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:370851/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:36531/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:357372/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:349934/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:34580/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:343113/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:33986/1‑41 (MQ=255)
ccGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAc  >  1:332079/1‑41 (MQ=255)
|                                        
CCGAATGATGCGACATATTCATAAAGTGAGCCAAATCTGAC  >  minE/1338547‑1338587

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑