Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1494291 1499134 4844 173 [0] [1] 456 [nuoG]–[nuoC] [nuoG],nuoF,nuoE,[nuoC]

Only 100 of 456 total aligned reads displayed.

TCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACC  >  minE/1499131‑1499183
    |                                                
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:60920/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:711936/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:705680/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:700767/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:688699/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:681453/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:674910/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:671137/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:657529/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:652353/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:646376/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:63059/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:627463/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:727673/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:604583/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:592381/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:579354/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:571668/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:568226/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:559143/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:557226/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:548551/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:539293/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:53399/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:524003/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:819821/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:938482/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:931610/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:920088/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:901756/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:896679/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:883944/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:879294/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:86672/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:857069/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:8493/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:838606/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:831114/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:515267/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:815154/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:807841/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:804100/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:781652/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:7650/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:75047/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:746172/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:743193/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:73907/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:735051/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:731089/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:195871/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:289229/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:284862/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:280693/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:258573/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:251506/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:244118/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:23799/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:230119/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:225075/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:217623/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:211367/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:207137/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:295974/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:189442/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:18201/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:177488/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:165813/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:155550/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:148701/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:140101/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:134676/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:124779/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:11243/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:107309/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:411752/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:502757/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:494238/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:486642/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:478887/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:472874/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:464546/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:460170/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:453316/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:447447/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:440005/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:43342/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:425004/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:101371/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:403865/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:384803/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:376596/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:37187/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:360470/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:356449/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:345732/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:342012/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:332696/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:32119/49‑1 (MQ=255)
    gTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGAcc  <  1:310548/49‑1 (MQ=255)
    |                                                
TCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACC  >  minE/1499131‑1499183

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑