Missing coverage evidence...
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CAATAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCT  >  minE/2283093‑2283155  |                                                              cAATAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTgcg    <  1:4321/61‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCTCGTTTGCGCt  <  1:724211/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:51247/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:925905/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:919486/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:914724/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:913320/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:849283/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:830561/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:813710/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:799328/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:776894/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:756953/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:669268/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:667289/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:102711/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:473482/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:449400/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:402406/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:390646/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:318978/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:318565/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:244449/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:20816/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:204774/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:165818/62‑1 (MQ=255)  aaTAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCt  <  1:115026/62‑1 (MQ=255)  |                                                              CAATAGTGCGGCGTGGTTCCGGCTTAATGCACGGCAGATAAACAACCCCATCGCGTTTGCGCT  >  minE/2283093‑2283155

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑