Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE1,198,1360GA45.8% 79.4 / 216.2 168A50T (GCG→ACG) yoaChypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (91/0);  new base A (77/0);  total (168/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 168 total aligned reads displayed.

GCGCCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGA  >  minE/1198103‑1198164
                                 |                            
gcgcCAACATCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:256352/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAg   >  1:541013/1‑61 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAg   >  1:876605/1‑61 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAg   >  1:159364/1‑61 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAg   >  1:325920/1‑61 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAg   >  1:205122/1‑61 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:789694/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:104107/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:493462/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:468777/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:778798/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:445838/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:381883/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:434606/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:430796/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:800622/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:398790/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:393171/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:384652/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:941949/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:506462/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:524274/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:770502/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:555388/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:750707/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:56892/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:581190/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:582757/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:591428/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:611894/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:623432/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:744488/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:644455/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:714811/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:689878/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:8522/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:141405/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:154780/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:136281/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:175641/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:18286/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:900431/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:882433/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:210933/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:257781/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:114201/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:276823/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:277925/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:282206/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:35790/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:843892/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:311273/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:828008/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:313827/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:828601/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:326425/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:805315/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:340131/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAata           >  1:32198/1‑53 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAg   >  1:381386/1‑61 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:925922/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:732340/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:727558/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:50114/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:708226/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:746972/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:906984/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:760888/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:869055/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:865624/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:771871/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:835411/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:367775/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:104429/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:129981/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:161993/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:197285/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:205772/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:260192/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:265061/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:266133/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:277665/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:293691/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:333707/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:341994/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:351281/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:689510/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:418184/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:43653/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:44864/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:453407/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:543232/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:552844/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:557650/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:601916/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:63512/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:63623/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:660046/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATCTAAAAGa  >  1:669589/1‑62 (MQ=255)
gcgcCAACACCAAGTTCGAAGAATGAAAGCACGACGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGa  >  1:678312/1‑62 (MQ=255)
                                 |                            
GCGCCAACACCAAGTTCGATGAATGAAAGCACGGCGAAGGGAATCTTTAAATATTTAAAAGA  >  minE/1198103‑1198164

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑