BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	1,409,493	A→G	Y59Y (TAT→TAC)	yejG ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	1,409,493	0	A	G	100.0%	2983.3 / NA	923	Y59Y (TAT→TAC)	yejG	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (0/923); total (0/923)

Only 100 of 923 total aligned reads displayed.

GAACATGGAACTTCGATGTCGCTTAACGCCTGGCTTAGTTTATACATCACC  >  minE/1409452‑1409502
                                         |
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aaCATGGAACTTCGATGTCGCTTAACGCCTGGCTTAGTTTGTACATCAcc  <  1:40422/50‑1 (MQ=255)
aaCATGGAACTTCGATGTCGCTTAACGCCTGGCTTAGTTTGTACATCAcc  <  1:87453/50‑1 (MQ=255)
aaCATGGAACTTCGATGTCGCTTAACGCCTGGCTTAGTTTGTACATCAcc  <  1:56014/50‑1 (MQ=255)
              gATGTCGCTTATCGCCTGGCTTAGTTTGTACATCAcc  <  1:812681/37‑1 (MQ=38)
               aTGTCGCTTAACGCCTGGCTTAGTTTGTACATCAcc  <  1:841564/36‑1 (MQ=255)
                                         |
GAACATGGAACTTCGATGTCGCTTAACGCCTGGCTTAGTTTATACATCACC  >  minE/1409452‑1409502

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 21 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`