| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | minE | 1,627,422 | G→A | E507K (GAG→AAG) | tktB → | transketolase 2, thiamin‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 1,627,422 | 0 | G | A | 99.7% | 1170.0 / ‑4.7 | 334 | E507K (GAG→AAG) | tktB | transketolase 2, thiamin‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (333/0); total (334/0) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 334 total aligned reads displayed.
GTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTGAGCGCCACAACGGACCGAC > minE/1627379‑1627441 | gTGCGATTAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:16860/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGTTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:92118/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCTGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:837524/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTGAGCGCCACAACGGACCGa > 1:584319/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCGCAACGGACCGa > 1:249773/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGTACCGa > 1:814034/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGAc > 1:263151/1‑59 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACTGa > 1:215755/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCg > 1:539887/1‑61 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCg > 1:657690/1‑61 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCg > 1:547730/1‑61 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:686900/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:676162/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:671685/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:692651/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:700418/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:70786/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:653430/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:753614/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:71824/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:648731/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:63760/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:626097/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:609803/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:606317/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:604236/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:601053/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:578692/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:566664/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:556873/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:825674/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:933452/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:92926/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:912269/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:896468/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:885135/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:883855/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:876242/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:867428/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:852613/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:846692/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:834715/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:728958/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:82036/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:812047/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:800114/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:794105/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:76811/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:754635/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:52685/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:74468/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:737392/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:731810/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:220217/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:339586/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:330132/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:317956/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:314901/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:297392/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:287524/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:27313/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:26010/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:24376/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:241174/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:230388/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:346765/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:212553/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:201791/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:199647/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:190024/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:180423/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:175268/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:141351/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:13890/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:127006/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:111364/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:104724/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:438280/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:100785/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:510284/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:503785/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:496454/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:492555/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:482629/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:471713/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:465242/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:463175/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:45524/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:444524/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:532232/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:431006/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:424710/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:422753/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:407720/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:396043/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:380824/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:366984/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:359300/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCCACAACGGACCGa > 1:356013/1‑62 (MQ=255)gTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTAAGCGCAACAACGGACCGa > 1:349252/1‑62 (MQ=255) | GTGCGATCAGGTGGAAGCGGCGGTGGGCTGGAAGCTGGCGGTTGAGCGCCACAACGGACCGAC > minE/1627379‑1627441 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |