Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA minE 697,346 Δ2 bp coding (31‑32/1299 nt) appA → phosphoanhydride phosphorylase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE697,3430T.100.0% 463.1 / NA 105coding (28/1299 nt)appAphosphoanhydride phosphorylase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base . (0/105);  total (0/105)
*minE697,3440C.100.0% 463.1 / NA 105coding (29/1299 nt)appAphosphoanhydride phosphorylase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base . (0/105);  total (0/105)

Only 100 of 105 total aligned reads displayed.

CGATCTTAATCCCATTTTTATCTCTTCTGATTCCGTTAACCCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGT  >  minE/697323‑697387
                    ||                                           
cGATCTTATTCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1296122/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:456669/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:593997/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:574179/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:561445/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:558591/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:53098/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:529075/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:527073/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:513860/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:486753/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:484824/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:479739/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:594766/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:446042/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:426158/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:333256/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:287016/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:268336/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:219899/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:218891/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:212735/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:211318/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1881761/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1878303/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1873736/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:815102/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:986349/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:967164/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:93819/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:920513/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:904303/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:903419/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:899237/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:893848/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:867293/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:85997/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:85034/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1852838/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:774354/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:713847/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:713320/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:708248/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:697494/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:688807/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:666428/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:662481/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:605762/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:600286/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:595372/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:122764/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1043607/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1524285/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1511853/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1471081/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1452745/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1451299/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1447718/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1348528/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1320076/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1286064/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1281585/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:124986/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:153424/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1192266/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1167031/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1147792/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:113346/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1127200/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1126200/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1116927/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1090474/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1053871/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1051848/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1048534/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1710253/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1846027/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1845701/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1831203/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:18284/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1819885/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1758345/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1748152/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1744727/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1742544/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1741255/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1735301/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1545383/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1698976/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1686731/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1670738/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1655357/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1613524/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1605726/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1592972/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1588353/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1570033/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1547538/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCCGATAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:1049728/62‑1 (MQ=255)
cGATCTTAATCCCATTTTTA‑‑TCTTCTGATTCAGTTAACCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGt  <  1:455239/62‑1 (MQ=255)
                    ||                                           
CGATCTTAATCCCATTTTTATCTCTTCTGATTCCGTTAACCCCGCAATCTGCATTCGCTCAGAGT  >  minE/697323‑697387

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: