Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	2,086,627	Δ1 bp	coding (402/987 nt)	yqjG →	predicted S‑transferase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	2,086,625	0	C	.	97.4%	154.3 / ‑1.1	38	coding (400/987 nt)	yqjG	predicted S‑transferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (1/0);  new base . (37/0);  total (38/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-01

TCTCCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTTCCCGTGCTGTGGGACAAAAAG  >  minE/2086585‑2086645                                         |                     tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTTCCC‑TGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:267876/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:55979/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1769394/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1818367/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1850041/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1894642/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:197461/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:36298/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:498537/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:520444/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1685281/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:566339/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:590344/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:60459/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:613151/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:665512/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:665730/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:704193/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:774293/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1389171/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1028173/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1070051/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1209129/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1230053/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1291817/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1301836/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1307199/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:134435/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1352909/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1018959/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1407037/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1444866/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1471380/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1472230/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1511195/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1545654/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:1557766/1‑60 (MQ=255) tctcCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTT‑CCGTGCTGTGGGACAAAAAg  >  1:158221/1‑60 (MQ=255)                                         |                     TCTCCACGCCGATCCACACTACAGCGGACGAGTTACTGTTCCCGTGCTGTGGGACAAAAAG  >  minE/2086585‑2086645

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑