Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2777507	2777867	361	78 [0]	[0] 29	[arpA]	[arpA]

CAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATGA  >  minE/2777448‑2777506                                                           | cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:250748/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:618125/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:566743/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:522660/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:51786/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:481590/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:424320/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:326435/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:296227/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:639458/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1885413/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1857250/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1846880/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:181067/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1721347/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1701569/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1683692/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1024277/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:649796/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:706507/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:733598/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:812057/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:815236/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:823849/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:831354/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:909756/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:913164/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:935179/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:93654/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:93741/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:961286/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:995245/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:998730/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1293739/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1018274/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1045905/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1069746/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1105713/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1152905/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1161532/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1189022/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1192120/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:124341/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1268646/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1675830/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1297854/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1307722/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1345277/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:141367/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1654215/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1390212/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1606230/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1504883/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1605798/59‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATACTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:457540/59‑1 (MQ=255) cAGATTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:241330/59‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1086443/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:185055/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1167533/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1831553/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1602683/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:915369/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1199701/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1067931/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1681555/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:765936/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1221123/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1492108/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1885367/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1270086/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1465563/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:458341/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:428305/58‑1 (MQ=255)  aGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:381389/58‑1 (MQ=255)                acgTGGATAATTTAATGACATAATCCTTGTTGCTAAAGATTTga  <  1:1172717/44‑1 (MQ=37)                     gAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1268716/39‑1 (MQ=255)                      aaaaTTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:1264197/38‑1 (MQ=255)                         aTTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATga  <  1:656015/35‑1 (MQ=255)                                                           | CAGCTTGTAAGACGGACGTGGAAAATTTAATGACAAAATCCTTGTTGCTAAAGATATGA  >  minE/2777448‑2777506

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑