Missing coverage evidence...
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CTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCATGTG  >  minE/2798401‑2798462                                                              | cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACCTGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:525665/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:985496/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:1147331/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:958488/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:951127/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:923107/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:820532/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:753586/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:686049/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:558600/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:381406/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:261854/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:1602302/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:1530936/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:1528871/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:1452422/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:144461/62‑1 (MQ=255) cTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCAtgtg  <  1:1227246/62‑1 (MQ=255)                                                              | CTGGCACTGTTCAGGATGACGACACGCTTCCACTTCTACACATGCCGCACAGAGCCCATGTG  >  minE/2798401‑2798462

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑