Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2811641	2811647	7	48 [0]	[0] 90	uvrA	ATPase and DNA damage recognition protein of nucleotide excision repair excinuclease UvrABC

TTCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGAA  >  minE/2811579‑2811640                                                              | ttCCGTCTCTTTATAGCGGCTCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:369864/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGATCGGATGACGACGaa  <  1:760951/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGACCGGATGACGACGaa  <  1:169454/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGTATGACGACGaa  <  1:1420692/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1025484/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1835754/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:308316/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:318519/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:391456/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:484147/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:51318/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:535300/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:565010/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:580040/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:58024/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:611577/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:671800/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:712775/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:756765/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:868543/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:906873/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:940773/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:966638/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1469991/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1026909/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1027929/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1078453/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1079851/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:108436/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1143423/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1170678/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1214279/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1226609/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1418288/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1806472/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1546013/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1638738/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:165465/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1679765/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1701069/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1713700/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1763629/62‑1 (MQ=255) ttCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1789945/62‑1 (MQ=255)  tCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:1458830/61‑1 (MQ=255)  tCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:782141/61‑1 (MQ=255)  tCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:199362/61‑1 (MQ=255)                     gcTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACTaa  <  1:289467/42‑1 (MQ=255)                           tattatGCAGCACGCGTTCGAACGGATGACGACGaa  <  1:414213/36‑1 (MQ=255)                                                              | TTCCGTCTCTTTATAGCGGCGCTCCATATTATGCAGCACGCCTTCGAACGGATGACGACGAA  >  minE/2811579‑2811640

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑