Missing coverage evidence...
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CCGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGAA  >  minE/2877359‑2877420                                                              | ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCGGCTGaa  >  1:1518922/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:81746/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:1258996/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:739757/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:685418/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:654068/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:423493/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:408516/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:298684/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:25658/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:206953/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:1882824/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:1875502/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:1844867/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:1840065/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:1812727/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:1794563/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:1789281/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:1747549/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:1734955/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:1717945/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:1712094/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:166891/1‑62 (MQ=255) ccGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGaa  >  1:1538847/1‑62 (MQ=255)                                                              | CCGGTAAACTGATCGACGGCACCGTGTTTGACAGCTCCGTTGCTCGTGGTGAACCCGCTGAA  >  minE/2877359‑2877420

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑