Missing coverage evidence...
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TGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTG  >  minE/2923396‑2923457                                                              | tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAGCTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1700696/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1760858/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:930724/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:906522/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:689443/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:630707/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:545494/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:401333/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:280267/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:229982/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1890845/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1839935/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1783380/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1778779/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:100088/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1751325/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1717703/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:158921/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1550374/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1445074/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1419643/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1399458/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1366044/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1328766/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:11978/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1142865/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1065729/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTGCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1861710/62‑1 (MQ=255) tGCGGCTCAATACCGTCCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:1179569/62‑1 (MQ=255)   cGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTg  <  1:50755/60‑1 (MQ=255)                                                              | TGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTG  >  minE/2923396‑2923457

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑