Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	308446	308455	10	67 [0]	[0] 10	maa/hha	maltose O‑acetyltransferase/modulator of gene expression, with H‑NS

GAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAAGA  >  minE/308406‑308445                                        | gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTTAGTGAaga  <  1:1179562/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCTGTGAaga  <  1:343776/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:629882/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:639537/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:629732/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:614630/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:51110/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:505192/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:493530/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:489840/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:452178/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:431298/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:431164/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:40410/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:393783/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:378142/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:357077/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:344086/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:792007/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:913286/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:908817/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:902007/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:897636/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:883532/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:816655/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:807644/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:803870/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:632562/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:75594/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:699246/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:694763/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:679200/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:677076/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:653816/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:340412/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1397175/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1047900/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1049002/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1067087/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1081591/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1116008/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1124091/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1143752/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1193523/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1210381/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1274485/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1306307/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1320959/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1325444/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1022659/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1517294/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:263201/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:248300/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:206498/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1856412/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1827786/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1796634/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1724656/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1569483/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1405544/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1499131/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1492964/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1472758/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:141857/40‑1 (MQ=255) gAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1417163/40‑1 (MQ=255)  aaaaTGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1216247/39‑1 (MQ=255)  aaaaTGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAaga  <  1:1279682/39‑1 (MQ=255)                                        | GAAAATGCGGCAACACAGTAAGACGAAAAGTCAGTGAAGA  >  minE/308406‑308445

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑