Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	308723	308759	37	94 [0]	[0] 6	hha	modulator of gene expression, with H‑NS

TTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCT  >  minE/308661‑308722                                                              | ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:331553/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:541005/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:478932/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:476563/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:448482/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:431223/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:427011/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:377097/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:365806/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:358652/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:346413/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:335115/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:551205/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:297906/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:293005/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:287661/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:278150/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:270653/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:259361/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:255082/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:252710/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:208220/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1886390/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1880817/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:813400/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:982673/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:964765/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:959342/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:92972/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:919849/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:913212/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:901639/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:882030/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:853435/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:829321/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:820148/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1871413/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:788819/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:776309/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:766970/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:722903/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:70837/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:702530/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:598146/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:596430/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:592435/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:551345/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1181231/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1332143/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1320025/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1317003/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1312861/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1268939/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1257334/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1240582/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1209117/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1208993/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1188290/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1184914/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1348835/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1179646/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1179386/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1173580/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1150233/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:114221/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1129530/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1125077/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1121451/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1113623/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1110632/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1079463/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1678318/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1854283/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1848355/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1823841/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1822563/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1798295/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1760065/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1729923/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1716740/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1704046/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1686078/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1681500/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1074349/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1672682/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1594398/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1524580/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1516625/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1487224/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1468142/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1452337/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1410970/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1377039/1‑62 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTAGCGCGTGTCAATTGTCt  >  1:1503956/1‑62 (MQ=255)                                                              | TTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCT  >  minE/308661‑308722

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑