Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 357461 357495 35 72 [0] [0] 45 sfmA predicted fimbrial‑like adhesin protein

TGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGT  >  minE/357400‑357460
                                                            |
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCTGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:973660/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:441170/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1749217/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:401933/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:398156/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:359949/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:279295/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:252324/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:228930/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:22499/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1888601/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1886877/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1883497/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1796923/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1794919/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1772872/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1027884/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:444143/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:480139/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:48697/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:49034/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:510056/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:531210/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:537020/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:555613/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:581501/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:594686/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:604517/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:610418/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:636211/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:667030/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:805931/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:809405/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:120681/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1375401/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1747686/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1331150/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:132769/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1258404/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1249158/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1244498/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1235418/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1343255/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1206163/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1102895/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1100726/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1090176/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1088070/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:107725/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1025492/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:173581/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1729591/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1692002/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1681643/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1377665/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1677685/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1573728/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1543097/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1519754/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1512767/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1479775/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1425682/61‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1384159/61‑1 (MQ=255)
agctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGGTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:608772/60‑1 (MQ=255)
 gctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1786209/60‑1 (MQ=255)
 gctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1110571/60‑1 (MQ=255)
 gctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1790957/60‑1 (MQ=255)
 gctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:692065/60‑1 (MQ=255)
 gctgcCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1361448/60‑1 (MQ=255)
            aGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:810158/49‑1 (MQ=255)
                  tACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:765745/43‑1 (MQ=255)
                     tGACTCGGCAGACCAGGTTCTCACACTCGGTCAATATCGt  <  1:1883594/40‑1 (MQ=255)
                                                            |
TGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGT  >  minE/357400‑357460

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: